影片讲述明朝中叶，宦官专权，大太监李进中主持东厂，上挟天子，下令百官，为虎作伥，陷害忠良。他利用从东瀛人北条夜姬处购买来的黑夜彼岸花炼制奇药，并在平民身上实验以达到自己炼制尸兵鬼侍的目的。在一次次实验失败后急需大量彼岸花，便与北条夜姬约定新的交易地点，便是龙门客栈，这次看似平常交易，暗藏了李进中的大阴谋，龙门客栈暗流涌动，四方云扰，风刀霜剑齐聚于此，在江湖掀起一场血雨腥风。

　　明朝有一个神秘的组织——玄衣卫，专门破获各种离奇事件，组员包括苗疆传人、萨满后裔等超自然界高手。故事讲述了玄衣卫被奸人陷害的几年后，邪恶组织过阴堂日益猖狂，皇城神枢营侍卫数月内多次无故失踪。皇帝大怒，特命玉麒麟彻查办此事。家国安危之下，前玄衣卫指挥使高建斌只身打探，在北镇抚司大战黑衣杀手，更是引出了背后更大的阴谋……

　　五枚师太、至善禅师、白眉道长、李巴山、冯道德、苗显六人师出同门，因武学理念不同个立门派。五枚师太无意中获得禁术《偃师献技》秘籍，习者可隔空控制傀儡人，无论古今往者或是生亡之人。与此同时，乾隆皇侄永坤试图通过缴杀武林名士敛学武功绝学，于是化名孙子义潜入峨嵋。恰逢峨嵋遭遇疟 疾危机，精通医理的白元明前来救急，与以李二环为首的峨嵋一众女弟子发生纠葛，意外卷入了江湖纷争之中……

　　战乱年代，群雄并起。割据一方的沛国安于现状，一任国主沛良（郑恺 饰）慨歌太平。要冲之地境州早年为强邻炎国借去，而今据而不还。沛国都督子虞（邓超 饰）前往讨伐，却中了对方大将杨苍（胡军 饰）的拖刀，重伤不愈。心有不甘的子虞暗中派出替身境州（邓超 饰）假扮自己，总理军政，内则使令夫人小艾（孙俪 饰）襄助。真假子虞切磋战法，寻求破解杨苍刀法的绝技。而另一方面，沛良恼怒子虞私自约战杨苍，不惜将妹妹青萍（关晓彤 饰）嫁于杨苍之子为妾媾和。淫雨霏霏，连日不开。境州上空，杀戮与机谋纠缠撕裂……
　　本片根据朱苏进的剧本《三国•荆州》改编。

　　一位手执名剑“长光”的年轻剑客（谢霆锋 饰）只为完成师父生前的遗愿——找到古代中原留下的九大旷世名剑，从北方蓬莱来到中原。而此前早已归顺朝廷的山东武林盟主、青萍剑客白三空（计春华 饰）利用与年轻剑客的比武诈死，成为朝廷埋藏在武林中的黑手。白三空的外孙方宝玉（乔振宇 饰）从小被外公禁止接触武功，然而为了替外公报仇，为了武林的正义，跟随“天下第一剑”紫衣候（谭耀文 饰）学武，誓要杀死蓬莱剑客。生命攸关的时刻，蓬莱剑客结识了黄河狂侠王巅之女珠儿（钟欣潼 饰），并且渐生情愫，方宝玉与紫衣候养女奔月（杨蕊 饰）两人也爱得难舍难分。青木堡少堡主木郎神君（赵鸿飞 饰）的朝廷锦衣卫身份终于暴露，朝廷意欲借武林中人控制武林，寻找罗雅古城宝藏的目的彻底呈现出来。
　　一场武林浩劫正在上演，每一个人的立场都真相大白。在纷争中发现对方竟是同母异父亲兄亲的蓬莱剑客和宝玉决定联手对付木郎神君，然而木郎神君已经炼成了混元神功，就在那千钧一发时刻，木郎神君死在了心爱的女人——脱尘郡主（伊能静 饰）的剑下，纷争也随之结束……

　　任道安借助杨家将之力，已将天门阵提升至人阵合一的境界。附近村落的无辜百姓被妖阵迷惑心智相互残杀，生灵涂炭。姜翠萍为了弥补自己的过错，假意拜师潜入任道安府内欲盗取布阵图，结果惨死在任道安掌下，杨家众人皆为之惋惜。天门阵人阵合一其中暗藏玄机，穆桂英和程刚认为妖阵命注必定与任道安生辰相连，由此推算出天门阵的心脏位置，便是其死门，直捣...

　　佘太君亲率众将出征边关，誓死破除天门阵。领军元帅的人选迟迟未定，杨八妹和穆桂英，一个精通兵法、一个善于布阵，一个征战边关多年深得将士信赖，一个统领穆柯寨拥有帅才之能，老太君权衡利弊最终决定任命穆桂英为三军统帅。众人对此皆表示不解，对桂英的能力缺乏信任。八妹亦心有所想，经过与太君长谈之后，她承诺会全力辅佐桂英，助其树立威信。　　对战天门阵，穆桂英领军有方，初战告捷。而杨八妹因故未遵号令及时撤回，被桂英依军法责罚守营三日，宗宝出面劝阻也被罚二十军棍。此举众人虽心存异议，却也震动于桂英的威严无私，八妹和太君则暗暗佩服桂英的治军严格。　　任道安设下毒计，利用姜翠萍将杨宗宝引入死阵，宗宝誓死不屈遭万箭穿心，惨死于天门阵。杨家上下悲痛万分，誓杀任道安以报绝后之仇。桂英终日思念宗宝，要追随亡夫而去，被八妹在崖边救下。七娘诊治之中惊喜地发现桂英已怀有身孕，这让杨家众人在悲痛之中重新看到了希望。桂英振作精神，为了国恨家仇要与辽军战斗到底。　　程刚潜心研究出新的破阵之法，却被姜翠萍盗走布阵图为任道安所用。杨家众人进入天门阵以降龙木合力破阵，却不知此乃任道安利用姜翠萍设下的圈套。得知真相后，程刚赶入阵内舍命相救，众人及时撤离了险境，程刚身受重伤生死难卜。姜翠萍终于醒悟自己一直被任道安所利用，却已为时晚矣。天门阵不破不立，此消彼长，任道安借杨家将及降龙木的合力，已将天门阵威力提升至无上境界。摆在杨门女将面前的是一个拥有摧毁众生之力的魔阵，穆桂英要破天门阵任重道远。

　　中央电视台电影频道播出的《杨门女将》系列电视电影，是在原电视剧版《杨门女将》基础上删剪而成的，分为以下15部分：
　　1． 《女儿当自强》
　　2． 《天波府风波》
　　3． 《女将初征 》
　　4． 《再战金沙滩 》
　　5． 《四郎探母 》
　　6． 《昊天塔 》
　　7． 《八妹游春》
　　8． 《白马贺寿 》
　　9． 《皇城惊变 》
　　10. 《巧夺凤发》
　　11. 《情定穆柯寨》
　　12. 《 战地情缘 》
　　13. 《辕门斩子 》
　　14. 《穆桂英挂帅 》
　　15. 《大破天门阵》

　　幽州城，风和日丽，汉人、辽人和睦相处，一派生机。佘太君将率众女将返回京都汴梁，杨六郎仍将镇守边关，保家为国。　　时孟良、焦赞从街市回营，神秘地向六郎禀报“秘密”消息，六郎制止。八妹伤愈，不愿继续养伤又挥剑练功，把整个梨片劈得满屋纷飞。当佘太君正率着杨门女将回朝之际，八妹却韧性要留下游玩数日，太君无奈，只好令杨安、杨排风也留下保护八妹，原来他们都有一个心气，要寻找老令公的骨殖，完成太君多年的心愿。　　孟良、焦赞探听到老令公的骨殖藏放在洪羊洞内。于是杨八妹、杨排风、杨安、孟良、焦赞就前往洪羊洞欲取回老令公的骨殖。当他们进入洪羊洞内，果真看到装有老令公骨殖的木盒及老令公的金刀。当杨八妹拿起木盒，谁知竟是假的，同时洪羊洞内机关响动，八妹险丧生，杨安见此情况，及时相救。五人经过苦战，方得逃离洪羊洞。神秘人姜彬巧遇杨八妹，提示老令公的骨殖应该放在至高至大尊至荣的地方。杨八妹聪明至极与孟良、焦赞分析老令公的骨殖可能放在昊天塔内。当杨八妹、杨排风、杨安、孟良、焦赞经过树林时，遇到黑衣人的伏击，孟良在迷雾之中误伤了焦赞，孟良痛苦万分。他们只好回到幽州客栈为焦赞治伤。　　杨八妹、杨排风、杨安三人独闯昊天塔，欲取回老令公的骨殖。五娘、孟良、焦赞因怕八妹等人有险，决定上五台山请五郎相助。当五娘上五台山时五郎正在闭关，任由五娘怎么谩骂，五郎就是不见，并以五郎八挂棍阻止五娘闯关……杨八妹等三人进入昊天塔内果然看见老令公的骨殖及金刀，可此时却落入了辽军圈套，三人浴血奋战险象环生。危机时刻，五郎及焦赞、孟良及时赶到相救，夺得了老令公的骨殖，杨家多年的心愿终于实现。

　　土城一战，宋辽阵势易改，两军势均力敌，萧太后为振军心，要到阵上犒军，二驸马木易与银镜公主随萧太后前往边关。得悉杨门女将出征，二驸马木易思绪万千……罗氏女领命前往辽营下休战书，与木易偶然相遇，大惊失色，原来木易就是杨令公之子杨四郎，是她日夜思念的夫君。杨四郎心中愧疚，向四娘道出当年金沙滩一役重伤之后得银镜公主所救，之后阴错阳差成为辽国驸马……罗氏女悲痛欲绝，同时又担心四郎的处境，两人回到宋军营帐，四郎含泪为母亲佘太君做了一碗凝神姜汤。杨四郎整日神色恍惚，银镜公主心中疑惑，看到丈夫烦闷之时所书"木易二字"，终于明白"木易"合为一字本就是个"杨"字。逼问之下，杨四郎终于坦言了自己的真实身份。银镜公主又惊又怒，欲杀木易但又不忍，细心想来，当年杨四郎所作所为并非欺骗，而是出于他的一片善心，一切只是缘分所弄。四郎希望再赴宋营，无奈萧太后战前封营，须令牌方可出入，银镜公主大义相助。在宋营厨房，四郎的到来终被发现，太君喜极而泣，但得知四郎现在的身份，盛怒之下欲杀逆子。四娘急忙上前阻劝，将四郎的苦衷一一道来……辽营，银镜公主痴痴地等候木易归来。萧太后得知木易是佘太君的儿子，要将银镜公主处斩，正在危急之时，赶回来的木易冲进来跪求太后开恩。萧太后下令攻城，让木易戴罪立功，木易无奈，只得领命。沙场上，木易跪在辽军与宋军之间，一手拿着辽旗，一手拿着宋旗，不杀一个宋兵，也不杀一个辽兵…… 几经波折，银镜公主与罗氏女再次相遇，两人心心相映并终以姐妹相称，佘太君原谅理解了儿子的抉择，杨家众人为四郎祈祷平安，目送杨四郎与银镜公主渐渐远去……