小兔她们现在已经升上初三了，战士们为了考上高中，组织了一个读书会，一起到小丽家中温习。素来有灵力的小丽做了一个怪梦，梦见救世主出现，世界毁灭，令她很担心。新的敌人死亡变种开始利用心魔，四处找寻拥有“纯真之心”的人，而那颗纯真之心即是塔利斯曼，集齐三粒塔利斯曼，传说中拥有极强大力量的圣杯就会出现。首先被心魔袭击的人就是小丽，其它战士想救她，但这次的敌人太强，众人不敌。突然有两位神秘的新战士出现，消灭心魔，她们的目的也是找寻心能水晶。小兔和小卫的爱产生了新的月棱镜，小兔获得更强大的新力量，对抗逼近的新敌人。阿兔她们认识了两个读无限学园高中一年级的新朋友 -- 打扮像男生的天才赛车手天王遥和高贵优雅的小提琴家海王满，众人都被她俩的风采迷倒了。神秘的新战士正式登场，原来是水手服战士水手天王星和水手海王星，不过她们的力量比内部战士强，而作战方式也很不同。转眼来到六月，小兔的生日到了，她想要一对玻璃鞋作生日礼物，小卫竟然不知道小兔快生日了，气得小兔掴了他一记耳光。在众人的提点下，小卫跑去买了那对玻璃鞋，小兔也去找小卫道歉。两人在街上相遇，小卫替小兔穿上玻璃鞋，心魔却在此时出现，要夺走小兔的纯真之心。混乱中，敌人嘉安莉兰特拾到小兔的月棱镜，知道小兔的真正身份，她捉住夜礼服假面，要胁小兔。小兔来到东京铁塔，为救小卫正准备交出纯真之心，水手天王星和水手海王星出现救了她。嘉安莉兰特揭穿小兔就是水手月亮，众人正惊讶，水手金星假扮水手月亮和其余战士出现，骗倒嘉安莉兰特。嘉安莉兰特攻击水手天王星和水手海王星，水手月亮说服大家齐心协力，拯救她们两人，终于战胜了嘉安莉兰特。
　　小小兔从未来回到现代，说是新倩妮迪女王要她来这里修炼。内部战士中，现在只剩美奈子从未成为心魔目标，她为了证明自己也拥有纯真之心，于是不断捐血，希望成为心魔目标。她的举动令众人担心不已，连小遥和小满也留意着她。终于心魔出现，取出美奈子的内心结晶，有惊人意志的美奈子竟然抱着自己的内心结晶跑到无人的地下停车场，小兔、小遥和小满追着她来到停车场，然后心魔就把各出入口封闭了。阿兔为救美奈子，被逼在敌人尤迪爱和小遥、小满面前变身，不过她仍不敌心魔。眼看美奈子的内心结晶要被拿走，小遥和小满也忍不住变身，成为水手天王星和水手海王星，救回美奈子。其它战士已到门外，尤迪爱以美奈子的性命作要胁，正要攻击时，美奈子也变身了，于是所有人的身份都暴露了。尤迪爱找到拥有心能水晶的人，于是约小遥和小满到水上大教堂。教堂内，尤迪爱捉住水手海王星，把她打到重伤，并取出她的内心结晶，第一粒塔利斯曼出现，再变成深海镜，水手海王星倒下。水手天王星把自己的塔利斯曼--宇宙剑取出，交给赶到的水手月亮后，也倒下了。尤迪爱抢走深海镜和宇宙剑，并攻击水手月亮。神秘女子冥王雪奈突然出现，变身成水手冥王星，用第三粒心能水晶 -- 权杖上的宝石拿回宇宙剑和深海镜，塔利斯曼再次回到水手天王星和水手海王星的身体，三人的力量令圣杯出现。水手月亮和尤迪爱去抢圣杯，水手月亮夺得圣杯，进行二段变身，轻易就打败了尤迪爱。
　　敌人和外部战士都发现水手月亮不是救世主，于是外部三战士的新任务就是要找出救世主。战士们认识了土萌萤，她是无限学园教授土萌创一的女儿，身体不好。土萌教授其实是死亡变种的高级干部，而无限学园就是死亡变种的大本营。小萤的身体好像有另一个人一样，常常不受控制，说出一些奇怪的话，又拥有医治创伤的神秘力量。小小兔和小萤非常要好，内部战士们也赞成她们做朋友，只是外部战士对小萤的力量存有怀疑。在一次战斗中，心魔的攻击打中小萤，小萤的额头上出现土星标记，证实了她就是毁灭战士水手土星。外部战士怕她会毁灭世界，想阻止她觉醒，但已经太迟了，她的身体已被死亡变种占据，吞下了小小兔的内心结晶后，变成了女主人9。一连串的事件，指出了无限学园就是死亡变种总部，众人于是向无限学园进发，迎战逼近的黑暗……

　　首次与友哈巴赫率领的星十字骑士团交锋后，尸魂界伤亡惨重，黑崎一护在零番队的帮助下前往灵王宫并最终炼出属于自己的斩魄刀“斩月”。与此同时，为了提升实力，其余“死神”也在瀞灵廷进行着自己的修炼，然而第二次交锋很快来袭，为了守护同伴和正义，护廷十三队热血迎战！

　　正是狂风暴雨时节，路飞、娜美、索隆等人登上一艘行将沉没的海盗船，并发现一个巨大的藏宝箱。众人费了九牛二虎之力，终于将箱子带回梅利号。结果发现，箱子里没有任何金银财宝，而是一个长相怪异且有些脱线的老太婆。老太婆唯恐路飞他们杀掉自己，于是许诺愿用金冠的秘密交换的生命。所谓金冠，传说是一顶价值连城的王冠，只有真正的海之王才能拥有。路飞相信了老太婆的话，于是扬帆朝目标之地挺进。
　　众人来至老太婆所住的机械岛，然而老太婆的儿子兰切特以为路飞等人是劫持了自己母亲的盗贼。他一面救回母亲，一面利用其研制的机械巨兵向梅利号展开攻击。寻找金冠的道路上危机重重……

　　很久以前，在宇宙中被粉碎的恶魔碎片，如今仍然祸乱着整个宇宙。
　　一名不知其真面目的恶徒正借着这些恶魔碎片危害四方，并将其魔爪伸向了光之国。
　　赛罗奥特曼和他的徒弟泽塔奥特曼勇敢地站了出来，正面迎击敌人。
　　经过一番激战，泽塔奥特曼独自一人追着怪兽前往地球。
　　在地球上，人们为了对抗日常出现的怪兽组成了防卫军——怪兽应对机甲部队“军械库（storage）”。在这支部队中有一位热血青年——夏川春树。
　　宇宙怪兽到达地球的那一刻，泽塔奥特曼和春树相遇了。自此两位热血青年的战斗故事开始了  。

　　突如、ザンクト・ポルトにいるアメリア軍の航宙艦が攻撃を受けた。スペースコロニー国家トワサンガが、地球への帰還を目指す「レコンギスタ」作戦を開始したためだった。ザンクト・ポルトには地球内外の4勢力が集結、それぞれが権利を主張して意見を戦わせる中、アイーダは真実を求め、ベルリや仲間とトワサンガを目指すことを決意する。そして月の裏側にあるトワサンガで、ベルリとアイーダに衝撃の事実が明かされる......。
　　ポスト宇宙世紀とも呼べる「リギルド・センチュリー（Regild Century＝R.C.）」を舞台に、ガンダムの原作者である富野由悠季自身が総監督・脚本を手がけた『Ｇのレコンギスタ』。その作品が5年以上の月日を経て、新たに劇場版として再編集された。2019年11月、2020年27月に上映された第1部、第2部に続く第3部はさらに新作カットを増し、ハイパーな作品としてよみがえる。今、時代を鮮やかに生き抜く若者たちの物語がここに!!

　　為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。

　　阳光明媚的一天，碧海蓝天，海鸥飞翔，在一座植被茂密的小岛上，漩涡鸣人、佐助、小樱以及井野、志乃登一众下忍没有任何修炼任务，而是悠哉游哉地坐在海边举行烧烤聚会，只不过这群性格别扭的家伙却分坐在不同地方，各自为政。超级贪吃的漩涡鸣人意外在沙滩下发现一支普普通通、破破烂烂的瓶子，他随手打开瓶盖，却从里面喷出一股浓郁的烟雾。烟雾散去，一个身形巨大的怪大叔出现，他就是传说中的壶中魔神，可以满足人们三个愿望。
　　鸣人他们起初并不相信魔伸的说法，但在见识了对方的法力之后，却不由得佩服起来。可惜他们有意无意浪费了两个愿望，而今只剩下最后一个，各怀私心的下忍们在岛上展开了一场激烈的争夺战……