特工总部迪亚大厦新增添了一个神秘的保险柜，结果引来了坏小子吉米的注意。他在两名笨蛋手下的协助下，成功将保险柜盗走，还顺带把迪亚大厦弄得七扭八歪。特工局长恼羞成怒，于是命手下去找特工腓力门及其搭档莫特德罗。腓力门是一个混迹于特工界的笨蛋，他不仅令上司十分头疼，还饱受民众的苛责。在接到局长的命令后，腓力门与莫特德罗准备出征，谁知就在此时，当年被腓力门送入监狱的暴徒特龙其母拉斯出狱，他发誓要用拳头给腓力门爆菊。经过一连串的周折，腓力门总算用特工总部开发的神秘药水使这个暴徒变成了温顺的好孩子。
　　与此同时，吉米的罪恶勾当仍在继续……

　　在崇山峻岭之间，塔莉娅（莫蕾娜·巴卡林 Morena Baccarin 配音）和儿子达米安（Stuart Allan 配音）隐居于此。他的外公瑞斯组建并训练刺客联盟，期待着下一个继任者的成长。谁知就在这一天，瑞斯当初的得意弟子“丧钟”斯莱德·威尔逊（Thomas Gibson 配音）带着叛变的刺客杀来，一番激战过后，瑞斯不幸身亡。在此之后，来不及悲伤的塔莉娅带着达米安来到哥谭市，寻找儿子的生身父亲蝙蝠侠布鲁斯·韦恩（杰森·奥玛拉 Jason O'Mara 配音）。从未谋面的父子，展开了磕磕绊绊的相处。
　　与此同时，丧钟的野心持续膨胀，当他的触角伸向哥谭市时，他终将和蝙蝠侠父子迎来一场大战……

　　《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。

　　未来世界的超级都市旧京山（San Fransokyo），热爱发明创造的天才少年小宏，在哥哥泰迪的鼓励下参加了罗伯特·卡拉汉教授主持的理工学院机器人专业的入学大赛。他凭借神奇的微型磁力机器人赢得观众、参赛者以及考官的一致好评，谁知突如其来的灾难却将小宏的梦想和人生毁于一旦。大火烧毁了展示会场，而哥哥为了救出受困的卡拉汉教授命丧火场。身心饱受创伤的小宏闭门不出，哥哥生前留下的治疗型机器人大白则成为安慰他的唯一伙伴。原以为微型机器人也毁于火灾，谁知小宏和大白竟意外发现有人在某座废弃工厂内大批量地生产他的发明。
　　稍后哥哥的朋友们弗雷德等人也加入进来，他们穿上小宏发明的超级战士战斗装备，和怀有险恶阴谋的神秘对手展开较量……

　　这是一个发生在神奇的食物世界的冒险故事。为了重补食物世界的创造者女娲的圣典《女娲食谱》，四海（馒头）、包强（包子)、油万金（油条）、巧巧（面条）、呙奎（烧饼）、花小蕾（花卷）和斗斗（饺子）等一群可爱的中国食物，和他们的好友武藏（坚强的寿司武士），驾驶他们的宝船——“蒸盒号”，进行食物世界的大航海历险。